生物資訊學mpss資料庫是什麼有什麼作用

2021-04-21 03:59:35 字數 4774 閱讀 3179

1樓:阿膠看到後

生物資訊學中kog資料庫

是什麼意思

根據需要從一級資料庫中蒐集物件的相關數回

據集合而成的就是答二級資料庫.

像genebank,embl這種都是不加選擇的一級資料庫,只要是實驗獲得的,不管什麼東西的序列,哪怕是不完整的序列都能上傳,而且它們的資料也有可能有重複.如果有某個人專門研究細菌的鑑定,需要用到正式被認可的16srdna序列,為了研究方便,把這些一級資料庫的各個種類細菌的公認標準16srdna序列的資料進行整理,重新構建了乙個資料庫,這就是所謂的二級資料庫.如果不構建,直接用一級資料庫做blast,就會得出很多未被承認甚至不完整的序列,還要人工乙個個看過去,找出公認的標準序列,這樣就很麻煩.

我舉得例子在現實中就是南韓的eztaxon.

什麼是生物資訊學中的二級資料庫?

2樓:浙大阿公尺巴

根據需抄要從一級資料庫中蒐集物件的相關資料集合而成的就是二級資料庫。

像genebank,embl這種都是不加選擇的一級資料庫,只要是實驗獲得的,不管什麼東西的序列,哪怕是不完整的序列都能上傳,而且它們的資料也有可能有重複。如果有某個人專門研究細菌的鑑定,需要用到正式被認可的16srdna序列,為了研究方便,把這些一級資料庫的各個種類細菌的公認標準16srdna序列的資料進行整理,重新構建了乙個資料庫,這就是所謂的二級資料庫。如果不構建,直接用一級資料庫做blast,就會得出很多未被承認甚至不完整的序列,還要人工乙個個看過去,找出公認的標準序列,這樣就很麻煩。

我舉得例子在現實中就是南韓的eztaxon。

3樓:洛克典

一、生物資訊學資料庫的種類

分子生物資訊資料庫種類繁多。歸納起來,大體可以分為4個大類:e5a48de588b662616964757a686964616f31333239303238

基因組資料庫

核酸和蛋白質一級結構資料庫

生物大分子(主要是蛋白質)三維空間結構資料庫

由上述3類資料庫和文獻資料為基礎構建的二級資料庫

一級資料庫(一次資料庫) :基因組資料庫來自基因組作圖,序列資料庫來自序列測定,結構資料庫來自x射線衍射和核磁共振等結構測定。這些資料庫是分子生物學的基本資料資源,通常稱為基本資料庫、初始資料庫,也稱一次資料庫。

二級資料庫(二次資料庫) :是在一級資料庫、實驗資料、理論分析的基礎上,衍生整理而得。它是根據生命科學不同研究領域的實際需要,對基因**譜、核酸和蛋白質序列、蛋白質結構以及文獻等資料進行分析、整理、歸納、注釋,構建具有特殊生物學意義和專門用途的資料庫。

一般說來,一級資料庫的資料量大,更新速度快,使用者面廣,通常需要高效能的計算機伺服器、大容量的磁碟空間和專門的資料庫管理系統支撐。

二級資料庫的容量則小得多,更新速度也不像一次資料庫那樣快,也可以不用大型商業資料庫軟體支援,這類針對不同問題開發的二次資料庫的最大特點是使用方便,特別適用於計算機使用經驗不太豐富的生物學家。

序列資料庫是分子生物資訊資料庫中最基本的資料庫,包括核酸和蛋白質兩類,以核苷酸鹼基順序或氨基酸殘基順序為基本內容,並附有注釋資訊。

genbank:由美國國家生物技術資訊中心(national center for biotechnology information, ncbi)建立(1979-1982)。該中心隸屬於美國國家醫學圖書館,位於美國家衛生研究院(nih)內。

embl:由歐洲分子生物學實驗室(european molecular biology laboratory, 其下有european bioinformatics centre)建立(1982),主要位於英國劍橋cambridge和德國漢堡hamburg。

ddbj:日本dna資料庫(dna data bank of japan)。由the national institute of genetics建立(1984-1987), nig主管。

二級資料庫的形式:大多以web介面為基礎,具有文字資訊、**、圖形、圖表等方式顯示資料庫內容。

一級資料庫與二級資料庫之間並無明確的界限。(例如:gdb、acedb、scop、cath等都已經具有二級資料庫的特色)。

4樓:匿名使用者

北京大學生物資訊中心有相關資訊介紹,請參見鏈結

,希望能夠對你專有所屬幫助。

資料庫的作用是什麼

5樓:匿名使用者

在大學的計算機教科書中,資料庫是被這樣解釋的:資料庫是計算機應用系統中的一種專門管理資料資源的系統。資料有多種形式,如文字、數碼、符號、圖形、影象以及聲音等。

資料是所有計算機系統所要處理的物件。人們所熟知的一種處理辦法是製作檔案,即將處理過程編成程式檔案,將所涉及的資料按程式要求組織成資料檔案,用程式檔案來呼叫。資料檔案與程式檔案保持著一定的對應關係。

在計算機應用迅速發展的情況下,這種檔案式方法便顯出不足。比如,它使得資料通用性差,不便於移植,在不同檔案中儲存大量重複資訊、浪費儲存空間、更新不便等。資料庫系統便能解決上述問題。

資料庫系統不從具體的應用程式出發,而是立足於資料本身的管理,它將所有資料儲存在資料庫中,進行科學的組織,並借助於資料庫管理系統,以它為中介,與各種應用程式或應用系統介面,使之能方便地使用資料庫中的資料。

這段說明介紹的確非常詳細,不過你可能看得頭暈眼花了,其實簡單地說資料庫就是一組經過計算機整理後的資料,儲存在乙個或多個檔案中,而管理這個資料庫的軟體就稱之為資料庫管理系統。一般乙個資料庫系統(database system)可分為資料庫(database)與資料管理系統(database management system,dbms)兩個部分。

6樓:風痕夕

20年全新mysql教程零基礎入門實戰 精講第一章 mysql 快速入門1.1 資料庫的作用

7樓:安徽新華電腦專修學院

將各種資料有序的管理起來,並對其他應用提供統一的介面和服務

8樓:匿名使用者

管理資料的 資料查詢,儲存一類的

9樓:匿名使用者

就好比你玩王者榮耀、lol

裡面的裝備資訊,怪物資訊,地圖等,都需要預先存放在乙個庫裡面,

這個庫就是資料庫

學資料庫有什麼用?

什麼是資料庫?資料庫有什麼用?

10樓:匿名使用者

什麼是資料

庫 金融資料分析與資料庫密不可分,那麼什麼是資料庫呢?在大學的計算機教科書中,資料庫是被這樣解釋的:資料庫是計算機應用系統中的一種專門管理資料資源的系統。

資料有多種形式,如文字、數碼、符號、圖形、影象以及聲音等。資料是所有計算機系統所要處理的物件。人們所熟知的一種處理辦法是製作檔案,即將處理過程編成程式檔案,將所涉及的資料按程式要求組織成資料檔案,用程式檔案來呼叫。

資料檔案與程式檔案保持著一定的對應關係。在計算機應用迅速發展的情況下,這種檔案式方法便顯出不足。比如,它使得資料通用性差,不便於移植,在不同檔案中儲存大量重複資訊、浪費儲存空間、更新不便等。

資料庫系統便能解決上述問題。資料庫系統不從具體的應用程式出發,而是立足於資料本身的管理,它將所有資料儲存在資料庫中,進行科學的組織,並借助於資料庫管理系統,以它為中介,與各種應用程式或應用系統介面,使之能方便地使用資料庫中的資料。

這段說明介紹的確非常詳細,不過你可能看得頭暈眼花了,其實簡單地說資料庫就是一組經過計算機整理後的資料,儲存在乙個或多個檔案中,而管理這個資料庫的軟體就稱之為資料庫管理系統。一般乙個資料庫系統(database system)可分為資料庫(database)與資料管理系統(database management system,dbms)兩個部分。

如何製作資料庫?

用最簡單的語言asp來做資料庫,以asp舉例.

1、問題:asp是一種程式語言嗎?

答:asp不是程式語言,而是一種開發環境。asp提供了乙個在伺服器端執行指令的環境,它利用了特殊的符號<>來區分html與必須經過伺服器翻譯才能送往客戶端的命令。

它可以執行的指令包括html語言,microsoft vbscript和microsoft jscript等,因此可以製作出功能強大的web應用程式。

2、問題:在web伺服器上容納多個web站點,能使用pws嗎?

答:在pws上只能容納乙個web站點。為了在相同的計算機上容納多個web站點,需要使用windows nt server或windows 2000 server/professional和iis。

3、問題:評介web資料庫管理系統時,應該考慮哪些問題?

答:在評價乙個web資料庫管理系統時,必須考慮到三方面的問題:多使用者問題;所建立的web資料庫應該是關係型的;資料庫的安全性問題。

4、問題:ado是什麼,它是如何運算元據庫的?

答:ado的全名是activex data object(activex資料物件),是一組優化的訪問資料庫的專用物件集,它為asp提供了完整的站點資料庫解決方案,它作用在伺服器端,提供含有資料庫資訊的主頁內容,通過執行sql命令,讓使用者在瀏覽器畫面中輸入,更新和刪除站點資料庫的資訊。

ado主要包括connection,recordset和command三個物件, 它們的主要功能如下:

·connection物件:負責開啟或連線資料庫檔案;

·recordset物件:訪問資料庫的內容;

·command物件:對資料庫下達行動查詢指令,以及執行sql server的儲存過程

11樓:匿名使用者

暈,就像彈藥庫一樣嘛.用來存放資料的東東!!!

什麼是生物資訊學中的二級資料庫生物資訊學MPSS資料庫是什麼,有什麼作用

根據需抄要從一級資料庫中蒐集物件的相關資料集合而成的就是二級資料庫。像genebank,embl這種都是不加選擇的一級資料庫,只要是實驗獲得的,不管什麼東西的序列,哪怕是不完整的序列都能上傳,而且它們的資料也有可能有重複。如果有某個人專門研究細菌的鑑定,需要用到正式被認可的16srdna序列,為了研...

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