高通量測序中講的通量和讀數應該怎麼理解呢?有沒有人可以講的詳

2021-03-27 06:29:04 字數 517 閱讀 5934

1樓:量子天堂

通量是指同時可以測的dna樣本數目的多少,一台第一代測序儀一次性最多只能測96個樣本,而一台第二代測序儀(高通量測序儀)可以同時測數萬個樣本。

乙個讀數(read)是指測序得到的乙個鹼基序列。

我的理解是:讀數就是乙個待測樣本的鹼基序列,是solex測序中的乙個術語,讀數越多,就證明測序的通量越大。

2樓:匿名使用者

roche/454 測序序列讀長(reads)在 3種測序技術中最長(600~1000 bp), 但其通量最低

(0.5~1 gb/run); illumina/solexa 測序通量大, 其新機型hiseq2000產出量為600 g/run, 但讀長比454測序短(通常為 100 bp); abi/solid 讀長最短(50 bp), 但

其創新之處在於雙鹼基編碼的應用, 降低了測序的錯誤率, 而且由於其雙鹼基編碼和校正系統的原理與重測序相似, 所以 solid 特別適用於具有高質量參考基因組序列物種的重測序.

高通量測序的insertsize怎麼計算

是你的插入片段,你要把建庫完成後的片段減去兩端加上的接頭和barcode長度就的出來的,一般建庫前和建庫後都會跑電泳或毛細管的,能得出長度 高通量測序insert size分布統計是怎麼計算的 說個最明了的辦法,用bwa比對軟體比對你的資料,比對結果中有一列就是insert size,直接統回計答 ...

高通量基因組測序中,什麼是測序深度和覆蓋

簡潔版 深度即 測序得到的總鹼基數 基因組鹼基數 也可以理解為將基因組測了幾遍。測序深度能減少假陽性和測序錯誤率。覆蓋度原來是指基因 轉錄組上測序測到的部分佔整個組的比例,但是現在很多人把coverage也直接當depth用了。詳細版 depth嘛,就是被測基因組上單個鹼基被測序的平均次數,比如某樣...

用二代高通量測序技術篩選的差異表達mirna需要用qrt pcr驗證嗎

microrna mirna 是真核生來物中一自 類長度在17 25nt,具有調控基因表達功能的非編碼小rna,其調控作用是通過剪下對應的靶基因或是抑制靶基因的翻譯來實現。大量實驗證據證實,mirna幾乎參與了所有的生理和病理過程,並在其中發揮重要的調控作用。我們為您提供基於二代測序illumina...