如何查詢某一基因的啟動子區有無某轉錄因子的結合位點

2021-09-06 19:12:31 字數 1806 閱讀 6171

1樓:匿名使用者

查詢某一基因的啟動子區有無某轉錄因子的結合位點可嘗試用缺失分析,應先用matinspector **有無轉錄因子結合位點的存在,然後將啟動子區域克隆,構建一系列區域突變克隆,與基因編碼轉錄因子的基因共表達,檢測報告基因的表達,來判斷轉錄因子的結合位點。

轉錄因子,真核生物轉錄起始十分複雜,往往需要多種蛋白因子的協助,轉錄因子與rna聚合酶ⅱ形成轉錄起始複合體,共同參與轉錄起始的過程。根據轉錄因子的作用特點可分為二類;第一類為普遍轉錄因子,它們與rna聚合酶ⅱ共同組成轉錄起始複合體時,轉錄才能在正確的位置開始。除tfⅱd以外,還發現tfⅱa,tfⅱf,tfⅱe,tfⅱh等,它們在轉錄起始複合體組裝的不同階段起作用。

第二類轉錄因子為組織細胞特異性轉錄因子,這些tf是在特異的組織細胞或是受到一些類固醇激素\生長因子或其它刺激後,開始表達某些特異蛋白質分子時,才需要的一類轉錄因子

2樓:檢驗教研室

這個目前好像還查不到吧,只有查文獻看別人的報道。因為如果可以根據結構或功能域去查的話,很多訊號通路的研究都不用那麼複雜了

如何在網上查某個基因的轉錄因子及啟動子

3樓:曉鶯殘歲月

查詢某一基因的啟動子區有無某轉錄因子的結合位點可嘗試用缺失分析,應先用matinspector **有無轉錄因子結合位點的存在,然後將啟動子區域克隆,構建一系列區域突變克隆,與基因編碼轉錄因子的基因共表達,檢測報告基因的表達,來判斷轉錄因子的結合位點。

轉錄因子,真核生物轉錄起始十分複雜,往往需要多種蛋白因子的協助,轉錄因子與rna聚合酶ⅱ形成轉錄起始複合體,共同參與轉錄起始的過程。根據轉錄因子的作用特點可分為二類;第一類為普遍轉錄因子,它們與rna聚合酶ⅱ共同組成轉錄起始複合體時,轉錄才能在正確的位置開始。除tfⅱd以外,還發現tfⅱa,tfⅱf,tfⅱe,tfⅱh等,它們在轉錄起始複合體組裝的不同階段起作用。

第二類轉錄因子為組織細胞特異性轉錄因子,這些tf是在特異的組織細胞或是受到一些類固醇激素\生長因子或其它刺激後,開始表達某些特異蛋白質分子時,才需要的一類轉錄因子

如何快速的找到轉錄因子和啟動子的結合位點

4樓:西北大學劉瑞

同一個基因的啟動子都是可長可短的,只是不同長度可能啟動子的活性不一樣。真核生物一般都是認為在第一外顯子上游的2kb以內(也有2kb以外的)。轉錄因子不同的**方法(除了promo,還可用jaspar 、tfsearch、transfac等資料庫)結果都不一樣,最終只有實驗驗證的才準確。

5樓:

chip-seq

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如何通過酵母證明啟動子和轉錄因子結合

6樓:芬達甲

查詢某一基因的啟動子區有無某轉錄因子的結合位點可嘗試用缺失分析,應先用matinspector **有無轉錄因子結合位點的存在,然後將啟動子區域克隆,構建一系列區域突變克隆,與基因編碼轉錄因子的基因共表達,檢測報告基因的表達,來判斷轉錄因子的結合位點。

轉錄因子,真核生物轉錄起始十分複雜,往往需要多種蛋白因子的協助,轉錄因子與rna聚合酶ⅱ形成轉錄起始複合體,共同參與轉錄起始的過程。根據轉錄因子的作用特點可分為二類;第一類為普遍轉錄因子,它們與rna聚合酶ⅱ共同組成轉錄起始複合體時,轉錄才能在正確的位置開始。除tfⅱd以外,還發現tfⅱa,tfⅱf,tfⅱe,tfⅱh等,它們在轉錄起始複合體組裝的不同階段起作用。

第二類轉錄因子為組織細胞特異性轉錄因子,這些tf是在特異的組織細胞或是受到一些類固醇激素\生長因子或其它刺激後,開始表達某些特異蛋白質分子時,才需要的一類轉錄因子

啟動子終止子會不會轉錄,DNA中的啟動子和終止子被RNA轉錄嗎

不會,啟動子是與rna聚合酶特異性識別的部位,終止子是轉錄終止的識別位點,他們的密碼子都沒有對應的轉錄氨基酸 dna中的啟動子和終止子被rna轉錄嗎 不含有bai 啟動子.但是含有du終止子序列zhi.啟動子是一段結合rna聚合酶dao的dna區域,在它的下游開內始容轉錄成mrna.把rna開始轉錄...

請問轉錄起始位點是啟動子的一部分嗎?啟動子包括轉錄起始點嗎

厄,不一定轉錄起始位點一般位於啟動子後面,當然,也有轉錄起始位點與啟動子有重合的還有一些trna和5srna是基因內啟動子 啟動子與轉錄起始位點各是什麼意思?有什麼不同?啟動子的意思是dna分子上能與rna聚合酶結合並形成轉錄起始複合體的區域,在許多情況下,還包括促進這一過程的調解蛋白的結合位點。轉...

高中生物,基因表達載體的構建中,啟動子和終止子是人工新增的

每個基因都帶有啟動子和終止 子。提取的目的基因本身就帶有啟動子和終止子,如果是通過逆轉錄方法合成的目的基因,就要先人工加上啟動子和終止子,再進行擴增。所以構建的目的基因表達載體上,目的基因的啟動子和終止子是跟目的基因一起接入載體的,但載體上原有的基因的啟動子和終止子則是載體本來就有的。高中生物,構建...