如何將測序資料上傳到ncbi的sra資料庫

2021-03-10 17:00:33 字數 1214 閱讀 2330

1樓:匿名使用者

一般上傳資料到ncbi sra的過程需要6步:

1、create a bioproject for this research

2、create a biosample submission for your biological sample(s)

3、gather sequence data files

4、enter metadata on sra website

a、create sra submission

b、create experiment(s) and link to bioproject and biosample

c、create run(s)

5、transfer data files to sra

6、update submission with pubmed links, release date, or metadata changes

需要注意的一點是,上傳的過程中很多地方一旦儲存或提交就不可以修改,尤其是各處的alias。但是,可以聯絡ncbi的工作人員修改內容。ncbi的工作效率是很高的,一般不超過48小時,就可以得到確認,並拿到登入號。

2樓:布達拉宮花園

隨著高通量測序的發展,海量的資料源源不斷的產生,以至於美國國家生物

版技術資訊權中心(ncbi)都受不了了,由於經費不足,於2023年2月關閉了sequence read archive(sra)資料庫,停止接受使用者提交的下一代測序資料。

近日,google和tpg biotech聯合投資1500萬美元致力於打造dna雲資料庫,google將和dnanexus一起接管ncbi的海量資料庫,繼續為科研人員提供免費的dna資料資訊。

從ncbi sra **的測序資料,分析後有了新發現,可以自己發文章嗎?

3樓:匿名使用者

親!!我想問問你怎麼**ncbi上的資料庫的,有的好大啊!我現在需要回microbe的序列,但是那個好像答10g,下 了一半又得從頭開始下,無語了。能教我一下嗎?

另外,您是在國內還是國外內?是研究生還是本科生還是工作人員呢?以前發過**嘛?

如果您的發現確實是新的,確實有突破(有可能別人已經發過相似的**,只不過您不知道而已),是可以發的。

4樓:匿名使用者

最好還是聯絡一下原作者,畢竟ncbi只是乙個平台

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